中国科学家团队建立水稻遗传解析新体系

来源: 上游新闻
2024-07-06 10:26:47

  中新网上海7月5日电 (记者 许婧)上海师范大学生命科学学院黄学辉教 授团队的最新研究成果在国际上首次揭示了水稻重要基因的网络,有望为提高水稻的产量和品质提供基因网络信息。

  这一重要研究成果5日以《通过"混血杂交"群体的组学研究揭示水稻性状的遗传构架》(Genomic investigation of18,421 lines reveals the genetic architecture of rice)为题,发表在国际著名学术期刊《科学》(Science)上。

  黄学辉当日受访时介绍:“我们团队把来自全球各地的水稻与中国的主栽水稻品种进行杂交‘混血’,创制了一万八千份水稻‘混血儿’,这些‘混血儿’在表型上千差万别,从这些表型出发,我们搞清楚了微观的基因和宏观的性状之间的联系,通过实验材料和方法的革新,为水稻高产、优质、多抗提供了宝贵的基因和材料。”

  各类复杂农艺性状由哪些基因决定、如何高效解析、基因之间有何联系,一直以来都是水稻等作物遗传研究的基本问题,也是实现水稻智能化育种的重要理论基础。

  研究团队综合亲本间基因变异、每套子群体的定位结果、基因表达、同源基因功能等多组学信息,开发了名为RiceG2G方法,打通了从遗传位点快速筛选到候选基因的关键一步,并通过遗传转化对少量新发掘基因进行了功能验证。

  据介绍,针对各类水稻育种性状,该研究鉴定到了1207个基因位点,每个性状平均可以检测出27.5个基因位点,并在此基础上系统解析了水稻基因的遗传互作网络。较以往工作,这项研究大幅提升了遗传定位的功效和分辨率,也大大加深了对水稻育种性状形成的了解。这套蕴含着丰富基因组合的遗传材料,还可以通过扩繁实现长期保存、反复使用,用于更多性状的基因鉴定。

  在八年的研究过程中,该团队克服了一个又一个困难。由于材料众多,时间紧任务重,负责性状调查的师生大部分时间都吃住在田间地头。调查高峰期需要百余人同时操作,找不到足够多的田间熟练工,课题组师生全员上岗,每天天不亮就下田、天黑才收工,风雨无阻地在田间劳作。

  这项研究涉及农学、生物学、信息学、统计学等多个学科。黄学辉团队构建了缜密而巧妙的研究思路,提前设计研究过程每个阶段的详细“图纸”;历经漫长而艰辛的群体构建之路,创制了研究所需的大规模实验材料,进行了基因组和表型组的测定;摸索出精细且具有创新性的分析方法,挖掘隐藏在大数据之下的重要基因和遗传学规律;最终取得突破性研究成果。

  该项研究获得国家重点研究计划青年科学家专项、国家杰青项目、国家优青项目及上海市植物分子科学重点实验室、上海市植物种质资源工程技术研究中心、上海市植物种质资源开发协同创新中心的资助。(完)

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张圣福

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